马尔科夫链模型

  这是一个模拟序列状态的实用统计工具。例如,与DNA序列相关的字符序列。序列中字符的同一性只依赖于紧邻前一个字符的同一性,从而模拟一些生物分子序列中的单独相关性。

  例如,P(C|T)表示当前字符为T下一个字符为C的概率。对于不同的DNA序列模型,这些概率有不同的值。例如,在CpG岛序列低于限额的序列中,P(G|C)的概率会非常小。

ATCG
P(A|A)P(A|T)P(A|C)P(A|G)
P(T|A)P(T|T)P(T|C)P(T|G)
P(C|A)P(C|T)P(C|C)P(C|G)
P(G|A)P(G|T)P(G|C)P(G|G)

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