Tassel结果的曼哈顿图绘制工具

【功能】

利用Tassel绘制的曼哈顿图并不好看， 可以利用该工具重新绘制曼哈顿图用于文章发表。

【测试】

安阳农科院 宋俊乔

新疆农业大学 任姣姣

沈阳农业大学 陈珊

沈阳农业大学 刘美玲

【图片展示】

【更新历史】

2023年5月9日

• 修正了CMplot包更新导致的问题。

2020年8月17日

• 增加了国内线路。

2020年8月6日

• 增加了QQ图的绘制。

2020年7月30日

• 修复了多性状画图出错的BUG。
• 修复了染色体中有NA画图出错的BUG。
• 增加了显示性状名称作为图片标题。

2020年7月1日

• 修正了数据无NA时报错的BUG。

2020年6月16日

• 增加了画阈值线功能，阈值需要用1e-x表示，无阈值线写NULL。

2020年1月14日

• 增加了自动去掉None数据的功能，避免程序出错。

• 结果自动命名为【原文件名_性状名】的形式。

2020年1月13日

• 利用CMplot包画TASSEL计算的结果的曼哈顿图。

【使用方法】

在Rstudio中运行下列代码。然后选择需要作图的TASSEL生成文件。文件名和路径中不要有中文，否则出错。

海外：

rm(list=ls())
threshold_line <- 1e-06   # threshold = 6 LOD or NULL
source("https://aozhangchina.github.io/R/manhattanPlot/manhattanPlot.r")   # 加载程序文件，需要联网

rm(list=ls())
threshold_line <- 1e-06   # threshold = 6 LOD or NULL
source("https://dataholdcn.cn/R/manhattanPlot/manhattanPlot.r")   # 加载程序文件，需要联网

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