【功能】
利用Tassel绘制的曼哈顿图并不好看, 可以利用该工具重新绘制曼哈顿图用于文章发表。
【测试】
安阳农科院 宋俊乔
新疆农业大学 任姣姣
沈阳农业大学 陈珊
沈阳农业大学 刘美玲
【图片展示】


【更新历史】
2023年5月9日
- 修正了CMplot包更新导致的问题。
2020年8月17日
- 增加了国内线路。
2020年8月6日
- 增加了QQ图的绘制。
2020年7月30日
- 修复了多性状画图出错的BUG。
- 修复了染色体中有NA画图出错的BUG。
- 增加了显示性状名称作为图片标题。
2020年7月1日
- 修正了数据无NA时报错的BUG。
2020年6月16日
- 增加了画阈值线功能,阈值需要用1e-x表示,无阈值线写NULL。
2020年1月14日
- 增加了自动去掉None数据的功能,避免程序出错。
- 结果自动命名为【原文件名_性状名】的形式。
2020年1月13日
- 利用CMplot包画TASSEL计算的结果的曼哈顿图。
【使用方法】
在Rstudio中运行下列代码。然后选择需要作图的TASSEL生成文件。文件名和路径中不要有中文,否则出错。
海外:
rm(list=ls())
threshold_line <- 1e-06 # threshold = 6 LOD or NULL
source("https://aozhangchina.github.io/R/manhattanPlot/manhattanPlot.r") # 加载程序文件,需要联网国内:
rm(list=ls())
threshold_line <- 1e-06 # threshold = 6 LOD or NULL
source("https://dataholdcn.cn/R/manhattanPlot/manhattanPlot.r") # 加载程序文件,需要联网