NanoString测序,双探针测序方案

NanoString技术是一种用于检测和量化特定核酸序列的高通量分子测量方法。它采用两种探针,捕获探针(Capture Probe)和报告探针(Reporter Probe)。

捕获探针通常由一个核酸序列构成,该序列能够特异性地与目标核酸的一部分互补配对。捕获探针的另一端附着有一个固定化分子——生物素,使得探针能够固定在芯片上。

报告探针同样包含一个能够与目标核酸另一部分特异性结合的核酸序列。与捕获探针不同的是,报告探针的另一端附有一个独特的彩色条形码(一系列彩色珠子),这些彩色的珠子用于识别当前探针对应的是哪条序列。

捕获探针与目标序列的5’端结合,报告探针与3’端结合,形成捕获探针-目标序列-报告探针的复合物。

具体步骤:

  1. 把mRNA样品裂解。
  2. 裂解液与探针结合。
  3. 洗脱未成为复合物的杂质。
  4. 将捕获探针-目标序列-报告探针复合物固定在带有链霉亲和素的芯片上。
  5. 利用电场使带电的彩色珠子倒向一边,并拉直序列。
  6. 利用光学扫描仪读取数据。

该方法不需要使用PCR扩增,能够真是的反应特征序列的数量。直接使用裂解液即可完成,不需要RNA提取和反转录。可以容忍一定成都的降解。实验重复性好。一次性可以测定数百种片段。

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