RNA测序,为了提取mRNA,可以用PloyT的探针。但是,如果想测miRNA、lncRNA、mRNA等的总RNA,又不想被rRNA干扰,那么只能针对rRNA设计探针。
前面说过,rRNA的序列是特定的,但是分为不同的类型。以真核细胞为例,rRNA有18SrRNA、5.8SrRNA、28SrRNA和5SrRNA等4种类型。那就要针对4种类型都设计探针,以拉取这些RNA。
需要注意的是,不同物种的rRNA类型和序列是不同的,这就需要针对不同物种设计不同的探针集合。这一点不像PloyT探针具有光适性,可以跨物种使用。
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