利用HMP文件遗传相似度

【功能】

利用HMP文件计算遗传相似度(genetic_similarity)。

数据中不能有NA。

【鸣谢】

四川农业大学 瞿静涛 算法思路

黑龙江农科院 曹士亮 测试

【更新历史】

2020年8月17日

  • 增加了国内线路。

2020年5月6日

  • 更换了计算逻辑,计算更快,但数据中不能有NA。

2020年4月18日

  • 增加了自动去掉None数据的功能,避免程序出错。
  • 结果自动命名为【原文件名_性状名】的形式。

【使用方法】

在Rstudio中运行下列代码。

海外:


source("https://aozhangchina.github.io/R/genetic_similarity/genetic_similarity.r")   # 加载程序文件,需要联网

国内:


source("https://dataholdcn.cn/R/genetic_similarity/genetic_similarity.r")   # 加载程序文件,需要联网

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评论

一条对“利用HMP文件遗传相似度”的回复

  1. guanghui hu 的头像
    guanghui hu

    牛人,希望继续努力,多出精品!

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