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  • 计算机的内部结构

    从广义上讲,很多东西都可以归为计算机。计算机主要包括三大部分:输入设备、处理设备和输出设备。凡是具备这三种设备的,都可以叫做计算机。比如,空调、冰箱就是调节空气温度的计算机;打印机、投影仪就是展示图像的设备。甚至一款支持特殊协议的充电线,由于里面有一个小小的芯片,又带有输入和输出功能,也可以归为计算机。

    根据广义上计算机种类的不同,有些功能可能会被阉割掉,以确保产品可以做的足够小并减少能耗。

    狭义上,我们通常说的计算机带有键盘、CPU和显示器的电脑。

    电脑的输入设备包括鼠标、键盘、麦克风、触屏等,而输出设备通常是显示器、屏幕、扬声器、耳机等。

    处理设备的核心是中央处理器(Central Processing Unit),它是计算机的大脑。CPU只能处理数字,高级的CPU每秒钟可以处理十亿条指令,每秒处理的量越大,CPU越强。

    CPU不仅可以处理指令,也能转移指令,指令通常可以转移到内存(Random-Access memory,随机存取器)中。

    内存是运行和跟踪程序时指令保存的空间。正在运行着的某个程序的基本属性、状态等都在内存中的某个位置存储着,便于随时调取。CPU从内存中获取需要的信息放在自带的存储池中(Cache)。无论cache还是RAM都是用二进制进行存储和处理的。二进制只包括两个数,0和1。每个二进制数(0或1)占1位(bit,比特)。所有的数字(十进制)、字母、文字、图像、文档、视频、游戏、代码等都可以用一系列01代码表示。

    硬盘(Hard Drive)也是一种存储器。与内存不同的是,内存是短期存储,只要一断电,内存的信息就会清空;而硬盘即便在没电的情况下,也能保持,再次通电即可从中提取信息。现在最流行的硬盘是固态硬盘(Solid-State Disk),它用电子元件(晶体管)存储二进制数据。而以前的硬盘通常叫做机械硬盘或硬盘驱动器(Hard Drive Disk),用旋转磁盘和磁针读写二进制数据。硬盘是必不可少的部分,用来存储操作系统、文件和重要信息。

    把上述部件联系在一起的东西叫做主板(motherboard)。它是一张很大的电路板,把各种部件固定在上面,同时保证这些部件可以保持同步,它也负责连接各种输入输出设备。

  • 【美丽自然】清澈的水域

    记录和留住那些美好,也许,现在能看到的,未来未必能看到。净化心灵,留住自然。

    阿拉斯加的美丽水域。

  • 真正免换水鱼缸——生态缸

      养鱼,主要用来观赏,而不是频繁的换水。

      现在有很多方法让鱼缸免换水,比较流行的是生态缸。生态缸用鱼、虾、螺、草、硝化细菌形成一个生态圈,通过打氧或过滤使鱼缸免于换水。不得不说,这是一个好注意,但是生态缸的必不可少的物件好像是气泵或水泵,这些东西最大的弊端是会造成噪音,白天可能觉察不到,而夜深人静,到了睡眠的时间,很可能会影响睡眠质量。很多人把鱼缸从卧室转移到大厅里。

      实际上,生态缸是可以不用电的,只需要水浅就行,也就是所谓的浅缸生态缸,大约10到15cm深。(1)鱼:比较合适浅水生态缸的鱼类包括孔雀鱼类、灯鱼类和斑马鱼类,这些都是比较耐活的,放在窗台上观赏性很好。(2)虾:以米虾为主,如果缸内藻类比较多,可以考虑水晶虾和苏虾,苏虾水温最好不要长期低于20℃,否则死亡是不可避免的。(3)水草:应选用真水草,即蜈蚣草、金鱼草等,这些水草是没有种子的,种出来的一般三个月或半年就要翻缸,水草种子主要用于快速成景比赛用的,生态缸不太适合。莫斯类也是非常好的水草,实际上莫斯是苔藓,很多苔藓都可以在水中生活,而且无需打理。莫斯钢片铺底是最快完成水下草坪的方案之一,用趴地矮珍珠种植在水草泥中也是不错的选择,只不过周期要长一些,需要耐心等待。(4)藻类:养鱼先养水,实际上是养藻,让藻类爆缸,鱼可以自己啃食藻类而无需喂食,藻类可以在某宝上搜索短融藻或者自己喜欢的不会绿水的水藻,当然绿水是非常适合养鱼的,由于观赏性不足,尽量不要选择绿藻。(5)螺:螺最好是选择神秘螺这类汽水螺,在缸内不能自己繁殖,苹果螺或者普通螺类会爆缸,很难看。最近我发现,大眼贼虾会吃螺下的卵,这种粘稠状物很是麻烦,如果螺爆缸可以试试下大眼贼。

  • “.hmp”——Hapmap格式

    HapMap是一种基于纯文本的遗传学格式,用于存储序列数据。单核苷酸多态(SNP)和种质的所有信息都存储在.hmp文件中。第一行为标题行,其他行包含了当前材料的SNP信息。前11列描述了SNP的属性,第12开始是SNP的碱基。

  • 外植体

    外植体是用于接种培养的各种植物材料。包括各种器官、组织甚至原生质体。外植体通常选择健壮植株无病虫的器官或组织。

    在植物组织培养中,外植体可以用于再生植株、诱导愈伤组织、转化外源基因等。

  • OPC纯化原理

    OPC纯化主要用于DNA的纯化。使用的是DMTr基,这是一种能够保护保护DNA合成中5’端碱基的大型疏水性基团,它的全称是4,4’-二甲氧基三苯甲基。它可以在碱性条件下与5’端的羟基发生反应,形成一个稳定的醚键。大概过程为:

    1. 将合成的寡核苷酸(带有DMTr保护基)加载到Cartiridge柱中,利用DMTr和树脂的亲和力,将DNA片段吸附到柱上。
    2. 用水或缓冲液洗涤柱子,去除非DMTr的序列、副产物和其他杂质。
    3. 用弱酸溶液洗脱柱子,去除DMTr保护基,释放纯化后的寡核苷酸。
  • Motif模体

    Motif是有特征的短序列,一般认为它是拥有生物学功能的保守序列,可能包含特异性的结合位点,或者是涉及某一个特定生物学过程的有共性的序列区段。模体可以从未注释的序列集合中,用MEME工具发现。

  • STS序列标记位点

    STS(Sequence Tagged Sites):序列标记位点。它聚合了SNP和重复序列,在染色体上只出现一次,可以作为基因组拼接的靶标。STS序列在不同物种之间可能有不同的特异性,取决于引物的设计和目标区域的保守性。有些STS序列可以用于跨物种扩增,从而研究基因组进化、生物地理和杂交区域。

  • GSS基因组勘探序列

    在NCBI中,GSS(Genome Survey Sequence)序列是一种基因组测序数据,是通过对基因组DNA进行一系列的碎片化、测序、拼接等步骤得到的序列数据。

  • EST表达序列标签

    EST标签是指表达序列标签(Expressed Sequence Tag)。

    早期对基因的测序使用的是建立文库的方式,即先提取RNA,反转录为cDNA,再打成片段连接到质粒上,形成文库,最后对文库中的每一段进行测序,也就有了EST标签,因此,EST标签实际上是一个完整基因的一小部分。随着基因组测序技术的发展,现在已经可以直接对全长进行测序,所以EST也就退出了历史舞台。NCBI的EST数据库也合并入核苷酸数据库。