全基因组选择简介

目前，常规育种主要依靠多年多点的表型数据结合系谱选择材料，会占用大量土地、人力和时间。然而，近些年作物产量增幅接近停滞，需要继续扩大规模才能保证产量的稳定增长。全基因组选择（Genomic Selection，GS）技术可以促进优良等位基因的快速聚合，加速育种循环。GS能在不鉴定表型数据的情况下，实现对种子的高通量大规模筛选，节约时间和大量土地。

_{Crossa, J, et al. “Genomic Selection in Plant Breeding: Methods, Models, and Perspectives.” Trends in Plant Science (2017).}

全基因组选择大致流程：
1. 组建具有丰富遗传变异的建模群体（training population，TRN）；
2. 对建模群体进行测序或基因分型，同时对该群体的田间表型进行测定；
3. 利用GBLUP或贝叶斯等算法将分子标记和田间表型数据结合起来，建立预测模型；
4. 对育种群体（testing population，TST）进行测序或基因分型，将获得的标记数据代入模型，计算出每份材料基因组估计育种值（genomic estimated breeding value，GEBV）；
5. 根据GEBV选择或筛选材料。